Pada tanggal 31 Januari 1999 di Ujong Batee, Aceh Besar, telah berkumpul para perwakilan masyarakat adat dari 50 gampông di Aceh. Mereka adalah kelompok-kelompok masyarakat adat yang selama ini menjadi korban pembangunan skala besar di Aceh dan diabaikan dalam pengambilan keputusan proyek skala besar itu sehingga melahirkan berbagai konflik. Misalnya, kebijakan berkait dengan pertambangan dan miga
s maupun Hak Penguasaan Hutan (HPH) telah mengakibatkan kerusakan lingkungan hidup dan membuat masyarakat kehilangan sumber penghidupannya. Selain itu masyarakat menjadi korban dari kebijakan politik pemerintahan yang otoriter dan hegemonik pada masa pemerintahan Orde Baru, yang mengkooptasi dan mendepolitisasi peran dan fungsi sistem institusi kepemerintahan adat. Konflik-konflik tersebut di atas bersumber dari pengabaian negara terhadap hak-hak masyarakat adat, baik terhadap sosial, hukum, politik, ekonomi maupun sumber daya alam. JKMA Aceh sebagai sarana masyarakat adat di Aceh untuk memperjuangkan pengakuan terhadap hukum, sosial, dan politik serta pengakuan hak-hak atas sumber daya alam, JKMA Aceh merupakan organisasi pergerakan dan payung organisasi masyarakat adat di Aceh untuk menyatukan perjuangan masyarakat adat di Aceh. Organisasi ini semula bernama JKMA merupakan singkatan dari Jaringan Kerja Masyarakat Aceh, tetapi dalam diskusi langkah-langkah kerja yang diadakan melalui Kongres I JKMA Aceh, seluruh peserta menyepakati perubahan singkatan menjadi Jaringan Komunitas Masyarakat Adat Aceh. Gerakan dan perjuangan JKMA Aceh tidak dapat dipisahkan dari gerakan masyarakat adat di tingkat nasional dan internasional. Di tingkat nasional JKMA Aceh menjalin aliansi strategis dengan Aliansi Masyarakat Adat Nusantara (AMAN), tetapi pada Kongres AMAN III di Pontianak tanggal 17-21 Maret 2007 JKMA Aceh menyatakan diri keluar dari keanggotaan AMAN, dikarenakan perbedaan visi dan misi. Dan di tingkat internasional JKMA Aceh bekerja sama dengan Assembly of First Nations Canada (AFN Canada) / masyarakat adat Kanada. http://www.jkma-aceh.org/?page=prf_history_id
